Ce o face deosebită este structura sa logistică. Mai exact, gara Shinjuku din Tokyo are nu mai puțin de 200 de căi de acces, astfel că pe peroanele ei tranzitează zilnic peste 3,5 milioane de oameni.
Gara are 36 de peroane și este cel mai aglomerat terminal de transport din lume.
Ea face legătura între traficul feroviar din Tokyo şi suburbiile de vest, fiind foarte utilizată și de navetişti.